На одной плате могут одновременно располагаться несколько версий PCI Express, которые совместимы между собой.
PCI Express - это интерфейс передачи данных, от версии которого зависит максимальная скорость передачи внутри самого устройства, например от видеокарты к процессору и оперативной памяти и жесткому диску.
Модель встроенного процессора, если он есть, если его нет - вы можете приобрести и установить его самостоятельно, выбирать нужно с совместимым сокетом.